碱基配对

（basepairing）核酸链间腺嘌呤和尿嘧啶（RNA）或胸腺嘧啶（DNA）以及鸟嘌呤和胞嘧啶的专一氢链结合。碱基配对是 DNA 和 RNA 双螺旋结构的基础，也是复制、转录作用的依据。分子杂交技术就是根据碱基配对的原理设计的。碱基配对后形成碱基对（basepair，bp），常用作 DNA 分子的量度， 如人类的线粒体 DNA 为 16569bp 。配对的碱基互称互补碱基

（complementarybase），若一条核酸链的碱基序列与另一条核酸链的碱基序列反平行配对，则二者互称互补链（complementarystrand），如与 RNA 互补的 DNA 称互补 DNA（cDNA）。