在药学方面，著有《本草纲目拾遗》

明代李时珍的《本草纲目》虽然收罗广博，但经过 200 多年的实践， 药学有了不少新的发展，况且《本草纲目》也远非十全十美。赵学敏通过广泛收集经史百家、地方志书、笔记等各种文献约 600 余种所载关于药学的资料，加上自己所采集到的标本及实践经验，大量补充了药物的新知识。在药物的分类方面，他在《本草纲目》16 个分部的基础上，又增加了花部、藤部，成为 18 个分部，使之更臻完善。他的《本草纲目拾遗》共收载药物

921 种，其中 716 种是《本草纲目》未曾收入的。这些药物中，有相当数量是由国外输入的外来药，有些还是他亲自登上外国船只进行实际调查所得的材料。他首次提到的刀创水，类似红汞或碘酒；金鸡纳（即奎宁）， 指出此物无形状可考，来自西洋，可以治妇人难产，治“发摆子”，亦即疟疾；镪水，性猛烈，能蚀五金等。类似这样的西药载入传统的本草著作， 开创了中西药汇合的先例。

赵学敏在《本草纲目拾遗》中，对巨著《本草纲目》正误计 34 条，其中有的是补充李时珍之不足，提出新的材料，有的则明确地指出其错误。他详细地叙述了《本草纲目》未提及的射罔的炮制，所述方法和步骤十分详尽；补充了关于天竺黄的采撮拾取以供药用的史料；对莽草这一当时用来毒鱼的有毒植物的特征，也补充了沈括提供的史料。对于《本草纲目》中混乱的品种，进行了鉴别，其中包括消石和朴消，盐硇和番硇，山慈姑

和石蒜，金锁匙和马蹄细辛，罗勒和兰香，菟葵和天葵，陆英和蒴■，牡丹皮和鼠姑，角蒿和茵陈，大腹子和大腹槟榔，红瑶柱和海镜，稷和粱等等。他还指出贝母有川贝母和象贝母之不同，大枣则南北互异，纠正了所谓铅粉无毒、上池水必须是树臼中水，食茱萸可供食用等错误或片面的提法。他以发展的眼光，明确地指出，自然界的物种是愈来愈多，愈来愈复杂的。例如白术已经繁殖出鸡腿术、狮子术等新品种。在他的著作中新列入的外来药物很多，包括镪水、倭硫黄、西洋参、东洋参、香草、阿勃参、西国米、阿迷酒、吕宋果等等，体现出中西药兼收的倾向。