世界闻名的生物模式标本产地

武夷山自然保护区丰富的植被，为生态系统的另一重要组成者——野生动物的生存准备了良好的栖息场所，并提供着丰富的食物。据统计，保护区中约有哺乳动物 100 余种，占全国同类动物总数的 1/4；鸟类约 400 余种， 几乎占全国总数的 1/3。鸟类是保护区中的动物之冠，仅在卦敦地区就记载约 160 余种，集中了全保护区鸟类总数的 1/4 以上，其中有 40 余种为本区所发现的新种，如白鹇、黄嘴角鸮、竹啄木鸟、卦敦鸦雀、白额山鹧鸪等；还有白背啄木鸟、橙背鸦雀、赤尾噪鹛、滇绿鵙鹛等为卦敦的特有种，故有人称这里是“鸟的王国”。

两栖和爬行动物约 100 余种。崇安髭蟾、蝾螈、三港雨蛙、大头平胸龟、丽棘蜥等均为世界罕见的特有种，所以这里又被誉为研究亚洲两栖和爬行动物的钥匙。鱼类也有 30 余种，新近还发现一个新种——武夷厚唇鱼。

保护区中昆虫的丰富程度也是中国其他地区少有的，全国昆虫 32 个目，

武夷山所采到的就占 31 目，估计可达 2 万余种之多，仅在盛产昆虫的大竹岚一地，到目前为止所发现的昆虫就达 300 多个科，占全国昆虫总科数的 1/3。被列为国家重点保护的珍稀动物有华南虎、白颈长尾雉、金猫、大灵猫、穿山甲、猕猴、云豹、毛冠鹿、鬣羚、短尾猴、小灵猫、黄腹角雉等。这些宝贵的动物资源在建立自然保护区后，得到了保护和管理。

保护区中丰富的动植物区系及大量新种的发现，使这个地区很早就已成为世界关注的动物模式标本产地。早在 19 世纪晚期，就有许多中外学者及商人在武夷山采集过大量珍贵的动植物标本，尤其是在卦敦和大竹岚一带发现不少新种，已成为世界闻名的生物标本采集地。100 多年来，从武夷山采到的动物标本中已发现 600 多个新种，在 5000 余公顷的范围内竟有如此之多的新种，实为世界所罕见的物种基因库。